Open ComposerはOpen OnDemand上で動作します。Open ComposerをOpen OnDemandのアプリケーションディレクトリ/var/www/ood/apps/sys/
に保存してください。
# cd /var/www/ood/apps/sys/
# git clone https://github.com/RIKEN-RCCS/OpenComposer.git
./conf.yml.erb.sample
を参考にして./conf.yml.erb
を作成してください。apps_dir
は必須です。scheduler
もしくはcluster
のどちらか1つは必須です。
項目名 | 設定内容 |
---|---|
apps_dir | アプリケーションのディレクトリ |
scheduler | 利用するスケジューラ(slurm 、pbspro 、sge 、fujitsu_tcs ) |
cluster | クラスタの定義 |
data_dir | 投入したジョブの情報のディレクトリ(デフォルトは${HOME}/composer ) |
login_node | Open OnDemandのWebターミナルを起動した際のログイン先 |
ssh_wrapper | SSHを用いて他のノードのジョブスケジューラを用いる場合のコマンド |
bin | ジョブスケジューラのコマンドのパス |
bin_overrides | ジョブスケジューラの各コマンドのパス |
sge_root | Grid Engineのルート用ディレクトリ(SGE_ROOT) |
footer | フッタに記載する文字 |
thumbnail_width | トップページの各アプリケーションのサムネイルの横幅 |
navbar_color | ナビゲーションバーの色 |
dropdown_color | ドロップダウンメニューの色 |
footer_color | フッタの色 |
category_color | トップページのカテゴリの背景色 |
description_color | アプリケーションページのアプリケーション説明の背景色 |
form_color | アプリケーションページのテキストエリアの背景色 |
ジョブスケジューラがslurm
の場合は、sbatch
、scontrol
、scancel
、sacct
を設定します。
bin_overrides:
sbatch: "/usr/local/bin/sbatch"
scontrol: "/usr/local/bin/scontrol"
scancel: "/usr/local/bin/scancel"
sacct: "/usr/local/bin/sacct"
ジョブスケジューラがpbspro
の場合は、qsub
、qstat
、qdel
を設定します。
bin_overrides:
qsub: "/usr/local/bin/qsub"
qstat: "/usr/local/bin/qstat"
qdel: "/usr/local/bin/qdel"
ジョブスケジューラがsge
の場合は、qsub
、qstat
、qdel
、qacct
を設定します。
bin_overrides:
qsub: "/usr/local/bin/qsub"
qstat: "/usr/local/bin/qstat"
qdel: "/usr/local/bin/qdel"
qacct: "/usr/local/bin/qacct"
ジョブスケジューラがfujitsu_tcs
の場合は、pjsub
、pjstat
、pjdel
を設定します。
bin_overrides:
pjsub: "/usr/local/bin/pjsub"
pjstat: "/usr/local/bin/pjstat"
pjdel: "/usr/local/bin/pjdel"
複数のジョブスケジューラを用いる場合に設定します。name
とscheduler
は必須で、それぞれクラスタの名前とスケジューラを設定します。また、他のスケジューラに関する設定(bin
、bin_overrides
、sge_root
)も可能です。注意点として、cluster
を設定する場合は、cluster
の外部でscheduler
、bin
、bin_overrides
、sge_root
を設定することはできません。
cluster:
- name: "fugaku"
scheduler: "fujitsu_tcs"
- name: "prepost"
scheduler: "slurm"
bin_overrides:
sbatch: "/usr/local/bin/sbatch"
Open Composerを/var/www/ood/apps/sys/
に保存すると、Open OnDemandのトップページにOpen Composerのアイコンが表示されます。Open Composerのアイコンが表示されない場合は、Open OnDemand用の設定ファイル./manifest.yml
を確認してください。
Open Composer上のアプリケーションをOpen OnDemandのトップページに表示することもできます。例えば、./sample_apps/Slurm/
というアプリケーションを表示させたい場合は、同名のディレクトリをOpen OnDemandのアプリケーションディレクトリに作成します(# mkdir /var/www/ood/apps/sys/Slurm
)。そして、そのディレクトリ内に下記のようなOpen OnDemand用の設定ファイルmanifest.yml
を作成します。
# cat /var/www/ood/apps/sys/Slurm/manifest.yml
---
name: Slurm
url: https://example.net/pun/sys/OpenComposer/Slurm
一般ユーザ権限でOpen Composerをインストールすることもできます。ただし、事前に管理者権限でOpen OnDemandのApp Developmentの機能を有効化する必要があります。
ナビゲーションバーの「</> Develop」の「My Sandbox Apps (Development)」を選択します(Webブラウザのウィンドウサイズが小さい場合は、「</> Develop」ではなく「</>」と表示されますので注意ください)。
「New App」をクリックします。
「Clone Existing App」をクリックします。
「Directory name」に任意の名前(ここではOpenComposer)、「Git remote」に「https://github.com/RIKEN-RCCS/OpenComposer.git」を記入し、「Submit」をクリックします。
「Launch Open Composer」をクリックします。